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Gabriel, vamos lá. O que você aproveita do alimento são as proteínas, sais minerais, água, carboidratos e gorduras. O seu organismo utiliza preferencialmente estes carboidratos para produzir energia para funcionar. Quando faltam carboidratos, ele usa gordura também.

Então, é medida em "calorias" a quantidade de "energia" que esse alimento guarda, ou seja, a quantidade de energia que ele seu corpo pode produzir a partir do consumo da quantidade X daquele alimento. Isso vai variar de alimento para alimento e 100 gramas de chocolate tem muito mais calorias que 100 gramas de... milho, por exemplo. Isso porque o chocolate tem muito mais carboidratos.

A energia que nós não usamos é armazenada no corpo na forma de gordura, ou seja, os carboidratos são transformados em gorduras e armazenados no tecido adiposo. Há também formas de armazenar o carboidrato sem transforma-lo, mas é uma quantidade limitada, sob a forma de "glicogênio".

Por fim, agora você já pode entender porque as pessoas engordam e emagrecem. Se elas consomem mais calorias do que o corpo usa diariamente... Essas calorias são armazenadas na forma de gorduras no tecido adiposo - já que seu corpo acha que "pode precisar um dia". Para emagrecer, o raciocínio é o oposto, ou seja, consumo abaixo do necessário OU consumo acima do ingerido.