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São da mesma família, mas tem funções completamente diferentes.

O ibuprofeno é mais utilizado como analgésico, antipirético e antiinflamatório de base em crianças de até 12 anos. Não que não pode ser usados em adultos, mas para adultos ele é meio fraco. É a droga mais segura para se administrar em crianças, a não ser que a criança tenha alergia conhecida ao ibuprofeno.

Agora o cetoprofeno é bem mais forte. É usado mais em casos de dor intensa relacionada a problemas ósseos e tendões. Por exemplo:artrite, artrose, dores lombares, dores no quadril, dores por ácido úrico nas articulações.

O ibuprofeno é isento de prescrição, o cetoprofeno só com prescrição médica.

Espero ter esclarecido a sua dúvida.

Ambos são derivados do ácido proprionico,o que muda nas suas fórmulas é a presença do radical acido acético na fórmula do cetoprofeno e a presença do radical metil-propil no ibuprofeno, ambos são anti-inflamatórios não-esteroides, analgésicos, antipiréticos(combate a febre) e anti-reumáticos, atualmente são uma alternativa a aspirina, o mecanismo de ação deles se dá inibindo a produção de substancias chamadas prostaglandinas que são mediadores da dor , ambos não devem ser administrados em suspeita de dengue porque interferem na coagualçao sanguinea, provocando hemorragias.

Não tome medicamentos por conta própria, isso pode matar você. Fiz isto com antibióticos e foi uma infecção atrás da outra. Vai ao médico.