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Correto é "a abençoe", porque nas frases exclamativas (que exprimem emoção, desejo) o pronome oblíquo deve ficar antes da forma verbal (proclítico)

Um abraço

Abençoe

Que Deus te Abençoe.

Depende da frase toda que se escreve. Ex:

a) Espero que Deus a abençoe;

b) Oh Deus, ela é uma pobre coitada, abenço-a, por favor.

Na minha opinião o correto é a abençoe.