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Depende do seu PC, tenta fazer um overclock, mas preferivelmente tira o som(não desliga as caixinhas ou tira pelo windows, desabilita o som do emulador), isso pode aumentar bastante a velocidade. Também ajuda se usar uma resolução baixa(nenhum jogo do PS2 usava resolução maior do que 720x480). Fora isso você tem que ir testando, emulação pesada varia de PC pra PC, às vezes desabilitando uma opção no seu PC pode aumentar bastante a velocidade, mas em outro não. Se você fala bem inglês, aconselho pedir ajuda no http://www.ngemu.com/forums/

Se possível, deixa o seu PC com 8gb de ram um Phenom II X6 3.2GHz e uma HD 7870(ou Geforce 660) . Aí você vai conseguir rodar como se fosse um PS2

Coloca um cilindro de nitro