Depende...

Se for o Skyrim lançado em 2011 ou então o Legendary Edition lançado em 2013, então não. Pode entupir o jogo de mods que as conquistas continuam funcionam perfeitamente.

Mas, se for o Skyrim "Special Edition" lançado em 2016, então usar mods desativa as conquistas sim, porem tem um outro mod (sério) que reativa as conquistas, o nome é Achievements Mods Enabler.

https://www.nexusmods.com/skyrimspecialedition/mod...

Leia com bastante atenção as instruções da página, tem até foto para vc ver aonde colocar os arquivos corretamente.

-Como eu disse, isso é somente para o Special Edition (ou "Skyrim remaster" se preferir), se vc usa o Skyrim 2011 ou o Skyrim Legendary 2013, não precisa se preocupar com nada disso. :)

Nunca instalei Mods

Não, tenho 6 mods da steam workshop e continuo ganhando conquistas.